Apotek Bona Mitra Keluarga adalah perusahaan dagang yang menjual produk-produk kesehatan, diantaranya obat cair, obat tablet, obat kapsul dan sebagainya. Saat ini, staf keuangan dalam mengelola data pembelian tidak mencatat pajak masukan, pajak penghasilan pasal 22, dan tidak terintegrasi dengan data penjualan. Oleh karena itu dibuat aplikasi berbasis web menggunakan framework CodeIgniter dan menggunakan database MySQL. Penyusunan dan pengembangan aplikasi menggunakan metode terstruktur, yang terdiri dari Unified Modeling Language (UML) dan Entity Relationship Diagram (ERD). Aplikasi mampu menghasilkan pembelian, persediaan, dan perhitungan pajak masukan, laporan persediaan, kartu persediaan, jurnal, dan buku besar.
Kata Kunci: Aplikasi Berbasis Web, Pembelian Persedian, Pajak Masukan, dan Pajak Penghasilan Pasal 22.